Вывод, что ты не можешь осмыслить за раз более одного предложения.

"Вре́мя - условная сравнительная мера движения материи, мера длительности процессов"
Распространение света в вакууме - это процесс не связанный со временем, но скажем, это процесс трения света об вакуум мешает свету распространяться мгновенно. Как и вся материя и энергия встречает постоянное сопротивление пространства "вакуума", а не времени. Постоянное за исключением эффектов гравитации и скорости.

Если считать вакуум субстанцией ("эфиром", "струнами", ещё чем), он находится везде. Включая пространство внутри самих атомов.

Масса фотона выражается не в атомном весе (относительно цезия-12), но намного порядков меньше.

Внутренний состав таких веществ как вода, стекло, воздух отталкивает фотоны, не давая к себе прилипать, по-этому они проходят сквозь.
Либо наоборот, их внешний заряд поглощает фотоны, не давая от себя отталкиваться, и по-этому они проходят сквозь.
Вероятность фотону случайно столкнуться напрямую с нуклидом входящим в состав атома незначительна.